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云和大數據

加速三代基因測序,探索生命奧秘,讓生命充滿希望

發布日期: 2022-04-16 10:00:20

希望組照片.png

武漢希望組作為國內首家三代測序服務公司,已經成為世界領先三代測序基因組中心,多年來深耕于三代測序分析領域,擁有最全面的平臺及最豐富項目經驗優勢,致力于為合作伙伴提供優質、高效的基因組測序組裝及分析服務。

基因研究一直是整個科學領域的一大高地。從技術實現的角度講,基因測序工程集合了DNA聚合酶、納米技術、高性能計算等領域尖端科技。如今第三代基因測序技術漸成主流。三代測序通過單分子實時測序、高分辨率光學圖譜技術和長讀特性在基因組研究中發揮著得天獨厚的優勢,對于農業、生命科學、醫學等領域意義重大。


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基因研究潛力無限,后端計算能力要跟上


武漢希望組作為國內首家三代測序服務公司,多年來深耕于三代測序分析領域,擁有最全面的平臺及最豐富的項目經驗,為合作伙伴提供優質、高效的基因組測序組裝及分析服務,已經成為世界領先的三代測序基因組中心。

基因測序工程,動輒需要數萬/數十萬個基因測序及模型建立,需要大量的計算和存儲資源。人體有23對染色體,31.6億個堿基對,一次30倍的全基因組測序的數據量大約200Gb,基因轉換—>拼接—>對比—>注釋全流程,用一臺高性能服務器運行耗時30多個小時。數萬/數十萬個基因測序任務,對網絡、存儲、算力及業務響應的及時性、可靠性、安全性有極高的要求。如果自建數據中心并且自運營運維,在技術、建設周期和成本上都面臨巨大的挑戰。

l端到端高性能解決方案讓瓶頸不再有為解決面臨的問題,武漢信諾瑞得信息技術有限公司聯合華為云經過充分溝通、探討和測試,為希望組提供了從計算、存儲、網絡到部署與運維等的端到端解決方案。

l華為云提供裸金屬服務器、大容量內存和大規模核心計算資源池,資源快速就緒,使測序原始數據處理速度得到快速提升。

l華為云貼近用戶需求,綜合運用 Docker、ARM等多種技術,將部分應用性能提升5-10倍。

l華為云及武漢信諾瑞得信息技術有限公司專業團隊負責整體的運維管理,大大降低了希望組的IT運維壓力,整體成本下降30%。





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